Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms