Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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