Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubxn4Q8VCH8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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