Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ccdc58Q8R3Q6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ccdc58Q8R3Q6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ccdc58Q8R3Q6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ccdc58Q8R3Q6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ccdc58Q8R3Q6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccdc58Q8R3Q6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc58Q8R3Q6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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