Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnaaf4Q8R368 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms