Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms