Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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