Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Abcf3Q8K268 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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