Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Neurl3Q8CJC5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms