Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Znf628Q8CJ78 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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