Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf1Q8CFK2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf1Q8CFK2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf1Q8CFK2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf1Q8CFK2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf1Q8CFK2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf1Q8CFK2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf1Q8CFK2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf1Q8CFK2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf1Q8CFK2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Brf1Q8CFK2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brf1Q8CFK2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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