Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cdc34Q8CFI2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cdc34Q8CFI2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cdc34Q8CFI2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cdc34Q8CFI2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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