Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp27Q8CEG8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms