Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup88Q8CEC0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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