Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lancl3Q8CD19 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lancl3Q8CD19 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Lancl3Q8CD19 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lancl3Q8CD19 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lancl3Q8CD19 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lancl3Q8CD19 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Lancl3Q8CD19 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lancl3Q8CD19 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lancl3Q8CD19 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lancl3Q8CD19 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lancl3Q8CD19 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lancl3Q8CD19 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms