Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms