Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf428Q8C1M2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms