Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek11Q8C0Q4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms