Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Atg16l1Q8C0J2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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