Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms