Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Triml1Q8BVP1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms