Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms