Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp43Q8BUM9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp43Q8BUM9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms