Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Slc5a7Q8BGY9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms