Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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