Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms