Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms