Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zbed4Q80WQ9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zbed4Q80WQ9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Zbed4Q80WQ9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zbed4Q80WQ9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zbed4Q80WQ9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Zbed4Q80WQ9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed4Q80WQ9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Zbed4Q80WQ9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Zbed4Q80WQ9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Zbed4Q80WQ9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms