Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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