Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dsg1bQ7TSF1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms