Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Actn1Q7TPR4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms