Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed3Q78IS1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms