Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Topbp1Q6ZQF0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms