Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80Q6ZPV2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms