Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms