Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SvoplQ6PDF3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms