Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp49Q6P9L4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp49Q6P9L4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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