Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms