Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
NipblQ6KCD5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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