Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tpm4Q6IRU2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tpm4Q6IRU2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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