Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Krt40Q6IFX3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Krt40Q6IFX3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Krt40Q6IFX3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Krt40Q6IFX3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Krt40Q6IFX3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Krt40Q6IFX3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Krt40Q6IFX3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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