Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rftn1Q6A0D4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms