Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall3Q62255 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms