Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rbm38Q62176 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rbm38Q62176 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rbm38Q62176 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbm38Q62176 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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