Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phox2aQ62066 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Phox2aQ62066 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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