Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga6Q61739 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms