Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cln3Q61124 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln3Q61124 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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