Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rbbp4Q60972 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms