Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms