Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

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Length 1,306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynrgQ5SV85 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms